Studio dell’espressione genica e della struttura dei trascritti
tramite sequenziamento di RNA full-length con tecnologia Oxford Nanopore®.
La trascrittomica consente di studiare la dinamica funzionale della cellula attraverso l’analisi delle molecole di RNA espresse in una determinata condizione biologica.
Mentre i metodi tradizionali frammentano l’RNA perdendo informazioni sulla struttura completa dei trascritti, la tecnologia Oxford Nanopore permette il sequenziamento di trascritti full-length, preservando l’informazione sulla struttura delle isoforme.
Attraverso il passaggio della molecola di RNA nativo o di cDNA full-length nel nanoporo, la tecnologia Oxford Nanopore misura variazioni di corrente caratteristiche associate alla sequenza nucleotidica.
Con l’opzione Direct RNA Sequencing è inoltre possibile sequenziare direttamente l’RNA nativo, evitando retrotrascrizione e amplificazione PCR e riducendo i bias di amplificazione.
L’analisi trascrittomica è eseguita su piattaforme Oxford Nanopore Technologies®, che consentono il sequenziamento di trascritti completi e l’analisi della struttura delle isoforme senza necessità di ricostruzione da frammenti corti.
Scopri di più sulla tecnologia nella
pagina dedicata al Sequenziamento Nanopore →.
Sequenziamento di trascritti completi per caratterizzare isoforme, eventi di splicing e fusioni geniche.
Sequenziamento diretto dell’RNA nativo senza retrotrascrizione o amplificazione PCR.
Offriamo un servizio end-to-end personalizzato per le esigenze di ricerca.
Il nostro team affianca il cliente dalla consulenza sul disegno sperimentale fino all’interpretazione biologica dei risultati.
Il servizio include:
La pipeline bioinformatica standard include:
Se richiesto, possiamo offrire integrazione multiomica, upload dei dati grezzi su repository pubblici e supporto per l’interpretazione biologica dei risultati.
L’analisi epigenomica consente di studiare i meccanismi di regolazione dell’espressione genica e le modificazioni del DNA in diversi contesti biologici.
Studio delle variazioni di espressione dei geni in diverse condizioni biologiche.
Analisi della diversità delle isoforme generate da eventi di splicing.
Studio dei programmi trascrizionali che regolano lo sviluppo e la specializzazione cellulare.
Analisi delle reti di espressione genica e dei pathway molecolari associati.
Competenze multidisciplinari in genomica, bioinformatica e biologia molecolare.
Supporto completo dalla progettazione sperimentale alla consegna dei risultati.
Piattaforme Oxford Nanopore per analisi genomiche con letture ultra-lunghe.
Collaboriamo con gruppi accademici, clinici e industriali per adattare il workflow alle esigenze di ricerca.
Probiomics supporta progetti di ricerca trascrittomica attraverso workflow completi di sequenziamento
e analisi dell’espressione genica, dalla pianificazione sperimentale all’interpretazione biologica dei risultati.
Raccontaci brevemente il tuo progetto o la tua esigenza analitica.
Il nostro team scientifico valuterà la richiesta e ti ricontatterà.
