Studio delle modificazioni epigenetiche
e dei meccanismi che regolano l’espressione genica
tramite sequenziamento diretto con tecnologia Oxford Nanopore®.
L’epigenomica studia i meccanismi che regolano l’espressione dei geni senza modificare la sequenza del DNA.
Grazie alla tecnologia Oxford Nanopore, è possibile analizzare direttamente diverse modificazioni epigenetiche sulla molecola nativa di DNA, evitando trattamenti chimici come la conversione bisulfitica e riducendo i bias introdotti dall’amplificazione PCR.
Questo approccio consente di osservare le modificazioni epigenetiche nel loro contesto genomico naturale, offrendo una visione più completa dei meccanismi di regolazione dell’espressione genica.
Il sequenziamento epigenomico è eseguito su piattaforme Oxford Nanopore Technologies®, che consentono la rilevazione diretta delle basi modificate attraverso variazioni del segnale ionico generato durante il passaggio del DNA attraverso il nanoporo.
Scopri di più sulla tecnologia nella
pagina dedicata al Sequenziamento Nanopore →.
Rilevazione diretta delle basi modificate sulla molecola di DNA nativa tramite sequenziamento long-read.
Studio delle modificazioni epigenetiche su DNA libero circolante per progetti di ricerca basati su biopsia liquida.
Quando una base modificata attraversa il nanoporo produce un segnale di corrente distinto rispetto alla base non modificata,
consentendo di identificare diverse tipologie di modificazioni epigenetiche:
Modificazione epigenetica coinvolta nella regolazione dell’espressione genica.
Associata a processi di demetilazione attiva e regolazione dinamica del genoma.
Modificazione osservata principalmente in organismi procariotici e in alcuni sistemi biologici specifici.
Modificazione epigenetica studiata in diversi organismi e coinvolta in specifici meccanismi di regolazione genomica.
Offriamo un servizio end-to-end personalizzato per le esigenze di ricerca.
Il nostro team affianca il cliente dalla consulenza sul disegno sperimentale fino all’interpretazione biologica dei risultati.
Campioni preparati secondo le specifiche concordate per garantire la qualità ottimale dell’analisi epigenomica.
Supporto nella progettazione sperimentale e gestione dell’intero flusso di lavoro:
La pipeline bioinformatica standard include:
Se richiesto, possiamo gestire l’upload dei dati grezzi su repository pubblici.
Possiamo gestire l’upload dei dati grezzi su repository pubblici e fornire supporto nell’interpretazione biologica dei risultati.
L’analisi epigenomica consente di studiare i meccanismi di regolazione dell’espressione genica e le modificazioni del DNA in diversi contesti biologici.
Studio dei meccanismi epigenetici che controllano l’attivazione o la repressione dei geni.
Analisi delle modificazioni epigenetiche associate alla regolazione genica e allo sviluppo di diversi processi biologici.
Studio dell’imprinting genomico, dell’inattivazione del cromosoma X e dei processi epigenetici coinvolti nello sviluppo.
Analisi delle modificazioni epigenetiche associate a fattori ambientali o condizioni biologiche differenti.
Competenze multidisciplinari in genomica, bioinformatica e biologia molecolare.
Supporto completo dalla progettazione sperimentale alla consegna dei risultati.
Piattaforme Oxford Nanopore per analisi genomiche con letture ultra-lunghe.
Collaboriamo con gruppi accademici, clinici e industriali per adattare il workflow alle esigenze di ricerca.
Probiomics supporta progetti di ricerca epigenomica attraverso workflow completi per l’analisi delle modificazioni del DNA,
dalla pianificazione sperimentale all’interpretazione biologica dei risultati.
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