Analisi avanzata di DNA e RNA
mediante sequenziamento long-read
per progetti di ricerca genomica, epigenomica e trascrittomica.
Il sequenziamento rappresenta uno strumento fondamentale per comprendere l’architettura e la funzione del materiale genetico.
Le tecnologie di terza generazione permettono la lettura diretta delle molecole di DNA e RNA, consentendo un’analisi più completa dei sistemi biologici.
Il sequenziamento del DNA è una metodica fondamentale per determinare l’ordine dei nucleotidi presenti in una molecola di DNA o RNA.
Questa tecnologia consente di studiare la struttura e la funzione del materiale genetico e di identificare variazioni che possono influenzare i processi biologici.
Negli ultimi anni le tecnologie di sequenziamento hanno subito un’evoluzione significativa: dalle tecniche tradizionali al Next Generation Sequencing (NGS), fino alle piattaforme di terza generazione, come quelle sviluppate da Oxford Nanopore Technologies.
Queste tecnologie permettono la lettura diretta delle molecole di DNA e RNA, fornendo informazioni più complete sull’organizzazione e sulla dinamica del genoma e del trascrittoma.
Queste tecnologie permettono la lettura diretta delle molecole di DNA e RNA, fornendo informazioni più complete sull’organizzazione e sulla dinamica del genoma e del trascrittoma.
La tecnologia Oxford Nanopore Technologies (ONT) rappresenta
una delle principali innovazioni nel campo del sequenziamento genomico.
Questo approccio consente di analizzare direttamente molecole di DNA o RNA mentre attraversano un nanoporo biologico, generando variazioni di corrente elettrica caratteristiche per ogni nucleotide.
Le variazioni di segnale vengono decodificate in tempo reale, permettendo di ricostruire la sequenza della molecola analizzata senza necessità di frammentazione o amplificazione.
Grazie a questo principio di funzionamento, il sequenziamento Nanopore permette di ottenere letture molto lunghe, consentendo l’analisi integrale di regioni genomiche complesse e facilitando lo studio dell’organizzazione strutturale del genoma.
Probiomics è certificata come Oxford Nanopore® Service Provider per l’utilizzo della tecnologia di sequenziamento per gli ambiti della genomica, epigenomica e trascrittomica
La certificazione attesta la conformità agli standard qualitativi definiti da Oxford Nanopore Technologies®.
Le tecnologie di sequenziamento di terza generazione, come Oxford Nanopore, consentono la lettura diretta di frammenti molto lunghi di DNA o RNA.
Questo approccio permette di analizzare regioni genomiche complesse che risultano difficili da ricostruire con tecnologie basate su frammenti corti.
Le letture long-read facilitano inoltre l’identificazione di varianti strutturali, il phasing aplotipico diretto e l’analisi completa dei trascritti.
Probiomics offre un servizio completo di sequenziamento basato su tecnologia Oxford Nanopore,
che copre tutte le fasi del processo sperimentale e analitico: dalla preparazione dei campioni alla generazione e interpretazione dei dati.
Preparazione e qualità del materiale biologico
Supporto nella preparazione dei campioni e nella definizione del protocollo più adatto per garantire qualità e integrità del materiale da sequenziare.
Generazione dei dati genomici.
Esecuzione del sequenziamento tramite piattaforme Oxford Nanopore per ottenere letture long-read adatte all’analisi di regioni genomiche complesse.
Validazione e controllo dei dati generati.
Elaborazione dei dati grezzi, controllo qualità e verifica dell’affidabilità dei risultati prima delle analisi successive.
Interpretazione biologica dei risultati.
Analisi bioinformatica avanzata per estrarre informazioni biologiche rilevanti e supportare l’interpretazione dei dati ottenuti.
I dati generati attraverso il sequenziamento possono essere integrati con altri livelli di analisi omica per ottenere una visione più completa dei sistemi biologici.
L’integrazione di dati genomici, epigenomici e trascrittomici consente di studiare in modo coordinato i meccanismi molecolari che regolano i processi cellulari e le basi biologiche delle patologie.
Questo approccio permette di collegare le informazioni genetiche alla regolazione epigenetica e all’espressione genica, supportando progetti di ricerca complessi e studi multi-omici.
L’approccio basato su tecnologia Nanopore consente di analizzare diversi livelli dell’informazione biologica, permettendo lo studio integrato di genoma, epigenoma e trascrittoma.
Sequenziamento dell’intero genoma per lo studio dell’architettura genomica, delle varianti strutturali e dei polimorfismi genetici.
Analisi delle modificazioni epigenetiche direttamente sulla molecola di DNA nativa.
Studio del trascrittoma attraverso il sequenziamento diretto dei trascritti completi.
I risultati delle analisi di sequenziamento vengono forniti sotto forma di dataset strutturati e report scientifici che facilitano l’interpretazione dei dati.
Risposte alle domande più comuni su campioni, analisi e risultati.
Probiomics offre diversi approcci di sequenziamento basati su tecnologia Oxford Nanopore, applicabili a differenti livelli di analisi genomica.
Tra i principali servizi disponibili:
Grazie alle letture long-read, questa tecnologia consente di analizzare regioni genomiche complesse, identificare varianti strutturali e caratterizzare in modo più completo i sistemi biologici.
Sono idonei diversi tipi di campione biologico, tra cui:
La tecnologia Oxford Nanopore consente di analizzare sequenze comprese tra 100 bp e oltre 50 Kbp, permettendo l’analisi di regioni genomiche complesse e l’identificazione di varianti strutturali.
I risultati vengono consegnati entro 2–4 settimane dalla ricezione dei campioni e della documentazione.
Per studi di grandi dimensioni è previsto un accordo personalizzato.
I risultati possono includere:
Sì. Il servizio di sequenziamento può essere integrato con analisi bioinformatiche avanzate, incluse pipeline di elaborazione dei dati, analisi comparative e interpretazione biologica dei risultati.
Sì, è possibile richiederne la restituzione al termine del progetto.
I risultati sono accessibili nell’area riservata del sito Probiomics.
La condivisione dei dati grezzi di grandi dimensioni viene gestita caso per caso in base alle esigenze dello studio.
Ogni progetto scientifico richiede un approccio metodologico adeguato e competenze integrate.
Il team di Probiomics supporta ricercatori e istituzioni nella progettazione e nell’analisi di studi genomici basati su tecnologie di sequenziamento avanzate.
Raccontaci brevemente il tuo progetto o la tua esigenza analitica.
Il nostro team scientifico valuterà la richiesta e ti ricontatterà.
